到达不久后，阿格里科拉便开始了大学教学生涯，梅兰希顿是他的学生，后来梅兰希顿成了著名的新教教育家。在海德堡期间，在海德堡主教的陪同下阿格里科拉去过沃尔姆斯，在此做过多次关于古典文化的讲座。
北欧文艺复兴的一个重要特点是学者们都比较重视神学和希伯来文化的研究，阿格里科拉亦不例外。1494年他一到海德堡就跟从一个有学识的犹太人学习希伯来语，目的是想借助于这种语言深入研究《圣经》和希伯来文化。他认为人文主义和宗教并不矛盾，同后来的罗伊希林和伊拉斯谟一样，他认为人文主义的方法有益于对基督教的起源进行深入全面的探讨。
阿格里科拉在海德堡任教不久就说他并不适宜于做教学工作，主要原因是他在精神上是个不安分的人，有那么多的新学问新知识需要去学习和探索，而教学工作比较单调，涉及的知识范围也比较狭窄，他想自由自在地探索新知而不是按部就班地传播已知。不久他又有了一个新机会。1484年8月教皇西克图斯六世去世，德国七大选侯之一的海德堡主教被选为新教皇，阿格里科拉是新教皇的密友，于是就做了教皇的秘书。由于身体原因，1485年10月27日阿格里科拉辞世，年仅41岁。
二、教育思想
阿格里科拉英年早逝，他留下的文字并不多，就像维多里诺一样他并不喜欢多写而是喜欢多学多做，他的个人发展本身就是一个留给世人的活教材。阿格里科拉并无专门的教育著作，1484 年在海德堡他给一位朋友写了封信，其中部分内容涉及他对教育的看法。