自从拜师之后，张仲景把全部精力都用在钻研医药、精究方术上面，他下定决心要做一个能“上以疗君亲之疾，下以救贫贱之厄，中以保身长全”的出色医生。有时候，他跟着张伯祖外出给人治病。在这个过程中，他注意观察病人的症状和气色，研究各种疾病症状与药理的关系。有时候，张仲景在家里钻研各种医学典籍，思考书本上的医学理论和临床医疗实践是否相符。随着临床经验的丰富，他对于医药理论的理解也进一步加深。有时候，张仲景晚上睡觉时想到一个问题，就赶忙记下来，第二天一大早，他就跑到师傅那里请教。张伯祖见他如此虚心好学，就把自己掌握的医术尽数传授给他。这样，日复一日，年复一年，3年的光阴很快就过去了。张仲景不仅丰富了自己的临床经验，在师傅的指导下读完了《黄帝内经》《难经》等医学书籍，还搜集了许多民间治病的偏方。张伯祖逐渐发现，张仲景的医术不在自己之下，甚至在许多地方超过了自己。有一天，他对张仲景说：“我已经不能再教给你什么了，现在你的医术在我之上，如果你还想进步，只能自己摸索了。”听完这番话，张仲景说：“师傅给予我的已经够多了，师傅的恩德徒儿永不会忘记，徒儿要把师傅的事业发扬光大。”从此以后，张仲景自立门户，各处行医。